Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 AC254633.1-201ENST00000606790 345 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 MIR6125-201ENST00000618986 96 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 AL137077.2-201ENST00000635124 1608 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 HNRNPA1P25-201ENST00000422644 937 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 LINC01875-201ENST00000454477 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CENPEQ02224 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms