Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 SH2D7-201ENST00000328828 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX1P83916 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX1P83916 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX1P83916 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX1P83916 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX1P83916 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX1P83916 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX1P83916 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX1P83916 SARDH-204ENST00000371872 3344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX1P83916 GOLGA6L4-202ENST00000422563 4155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX1P83916 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX1P83916 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX1P83916 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX1P83916 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX1P83916 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX1P83916 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX1P83916 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX1P83916 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX1P83916 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX1P83916 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX1P83916 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX1P83916 PDZD4-209ENST00000544474 3418 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX1P83916 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX1P83916 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX1P83916 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX1P83916 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX1P83916 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX1P83916 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX1P83916 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX1P83916 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX1P83916 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX1P83916 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX1P83916 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX1P83916 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX1P83916 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX1P83916 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX1P83916 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX1P83916 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX1P83916 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX1P83916 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX1P83916 NOA1-201ENST00000264230 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX1P83916 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX1P83916 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX1P83916 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX1P83916 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX1P83916 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX1P83916 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX1P83916 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX1P83916 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX1P83916 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX1P83916 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX1P83916 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX1P83916 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX1P83916 ZNF799-202ENST00000430385 2583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX1P83916 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX1P83916 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX1P83916 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX1P83916 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX1P83916 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX1P83916 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX1P83916 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX1P83916 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX1P83916 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX1P83916 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX1P83916 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX1P83916 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX1P83916 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX1P83916 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX1P83916 TJAP1-205ENST00000372452 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX1P83916 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX1P83916 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX1P83916 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX1P83916 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX1P83916 CELF4-218ENST00000591287 3757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX1P83916 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX1P83916 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX1P83916 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX1P83916 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX1P83916 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX1P83916 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX1P83916 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX1P83916 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX1P83916 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX1P83916 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX1P83916 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX1P83916 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX1P83916 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX1P83916 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX1P83916 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX1P83916 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX1P83916 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX1P83916 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX1P83916 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX1P83916 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX1P83916 ZFAND3-203ENST00000373391 3001 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX1P83916 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX1P83916 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX1P83916 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX1P83916 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX1P83916 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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