Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms