Protein–RNA interactions for Protein: P52294

KPNA1, Importin subunit alpha-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA1P52294 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KPNA1P52294 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KPNA1P52294 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KPNA1P52294 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KPNA1P52294 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KPNA1P52294 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KPNA1P52294 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KPNA1P52294 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KPNA1P52294 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KPNA1P52294 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KPNA1P52294 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KPNA1P52294 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KPNA1P52294 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KPNA1P52294 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KPNA1P52294 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms