Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP4P49662 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP4P49662 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP4P49662 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP4P49662 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP4P49662 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP4P49662 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP4P49662 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP4P49662 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP4P49662 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP4P49662 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP4P49662 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP4P49662 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP4P49662 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP4P49662 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP4P49662 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP4P49662 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP4P49662 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP4P49662 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP4P49662 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP4P49662 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP4P49662 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP4P49662 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP4P49662 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP4P49662 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP4P49662 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP4P49662 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP4P49662 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP4P49662 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP4P49662 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP4P49662 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP4P49662 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP4P49662 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP4P49662 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP4P49662 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP4P49662 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP4P49662 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP4P49662 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP4P49662 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP4P49662 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP4P49662 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP4P49662 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP4P49662 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP4P49662 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP4P49662 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP4P49662 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP4P49662 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP4P49662 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP4P49662 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP4P49662 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP4P49662 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP4P49662 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP4P49662 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP4P49662 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP4P49662 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP4P49662 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP4P49662 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP4P49662 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP4P49662 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP4P49662 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP4P49662 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP4P49662 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP4P49662 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP4P49662 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP4P49662 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP4P49662 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP4P49662 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP4P49662 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP4P49662 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP4P49662 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP4P49662 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP4P49662 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP4P49662 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP4P49662 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP4P49662 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP4P49662 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP4P49662 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP4P49662 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP4P49662 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP4P49662 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP4P49662 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP4P49662 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP4P49662 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP4P49662 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP4P49662 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP4P49662 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP4P49662 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP4P49662 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP4P49662 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP4P49662 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP4P49662 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP4P49662 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP4P49662 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP4P49662 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP4P49662 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP4P49662 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP4P49662 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP4P49662 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP4P49662 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP4P49662 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms