Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms