Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms