Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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