Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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