Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRTO14522 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms