Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 899 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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