Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms