Protein–RNA interactions for Protein: A6NJU9

NPIPB13, Nuclear pore complex-interacting protein family member B13, humanhuman

Predictions only

Length 1,138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB13A6NJU9 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms