Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms