Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SH3BP1Q9Y3L3 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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SH3BP1Q9Y3L3 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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SH3BP1Q9Y3L3 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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SH3BP1Q9Y3L3 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SH3BP1Q9Y3L3 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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SH3BP1Q9Y3L3 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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SH3BP1Q9Y3L3 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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SH3BP1Q9Y3L3 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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SH3BP1Q9Y3L3 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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