Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPS5Q9UPZ3 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms