Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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FOXD3Q9UJU5 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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FOXD3Q9UJU5 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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FOXD3Q9UJU5 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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FOXD3Q9UJU5 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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FOXD3Q9UJU5 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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FOXD3Q9UJU5 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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