Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms