Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms