Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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SUSD3Q96L08 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SUSD3Q96L08 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SUSD3Q96L08 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SUSD3Q96L08 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SUSD3Q96L08 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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