Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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