Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GCSAMQ8N6F7 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms