Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC33Q8N5R6 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms