Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPAP2Q8IXW5 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPAP2Q8IXW5 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPAP2Q8IXW5 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPAP2Q8IXW5 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPAP2Q8IXW5 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPAP2Q8IXW5 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPAP2Q8IXW5 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPAP2Q8IXW5 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPAP2Q8IXW5 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
RPAP2Q8IXW5 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
RPAP2Q8IXW5 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPAP2Q8IXW5 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPAP2Q8IXW5 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPAP2Q8IXW5 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPAP2Q8IXW5 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPAP2Q8IXW5 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPAP2Q8IXW5 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPAP2Q8IXW5 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPAP2Q8IXW5 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPAP2Q8IXW5 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPAP2Q8IXW5 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPAP2Q8IXW5 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPAP2Q8IXW5 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPAP2Q8IXW5 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPAP2Q8IXW5 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPAP2Q8IXW5 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPAP2Q8IXW5 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPAP2Q8IXW5 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPAP2Q8IXW5 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPAP2Q8IXW5 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPAP2Q8IXW5 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPAP2Q8IXW5 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPAP2Q8IXW5 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPAP2Q8IXW5 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPAP2Q8IXW5 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPAP2Q8IXW5 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPAP2Q8IXW5 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPAP2Q8IXW5 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPAP2Q8IXW5 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPAP2Q8IXW5 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPAP2Q8IXW5 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPAP2Q8IXW5 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPAP2Q8IXW5 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPAP2Q8IXW5 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPAP2Q8IXW5 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RPAP2Q8IXW5 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPAP2Q8IXW5 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPAP2Q8IXW5 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPAP2Q8IXW5 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPAP2Q8IXW5 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPAP2Q8IXW5 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPAP2Q8IXW5 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms