Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU7

SCX, Basic helix-loop-helix transcription factor scleraxis, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCXQ7RTU7 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SCXQ7RTU7 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms