Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PDZD4Q76G19 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms