Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB2

CXCL17, C-X-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL17Q6UXB2 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CXCL17Q6UXB2 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms