Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms