Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 AL513165.2-203ENST00000537239 717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 IGHV3-43-201ENST00000434710 434 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 AC021321.1-201ENST00000607397 1113 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 AL512324.3-201ENST00000619383 882 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms