Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms