Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TNIP1Q15025 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms