Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms