Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 TBC1D3P2-203ENST00000581291 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 USP17L7-201ENST00000530447 2022 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 BTNL8-201ENST00000231229 2229 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 CPT1C-204ENST00000405931 2785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 HLA-E-201ENST00000376630 2601 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 IGHG1-202ENST00000390548 2619 ntAPPRIS P5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 LPO-204ENST00000543544 2350 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 POU2F2-216ENST00000560558 3282 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 271.9 ms