Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME3Q13232 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME3Q13232 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME3Q13232 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME3Q13232 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME3Q13232 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME3Q13232 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME3Q13232 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME3Q13232 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME3Q13232 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME3Q13232 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME3Q13232 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME3Q13232 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME3Q13232 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME3Q13232 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME3Q13232 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME3Q13232 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME3Q13232 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME3Q13232 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME3Q13232 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME3Q13232 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME3Q13232 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME3Q13232 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME3Q13232 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME3Q13232 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME3Q13232 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NME3Q13232 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME3Q13232 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME3Q13232 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME3Q13232 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME3Q13232 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NME3Q13232 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME3Q13232 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME3Q13232 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME3Q13232 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME3Q13232 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME3Q13232 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME3Q13232 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME3Q13232 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME3Q13232 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME3Q13232 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME3Q13232 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME3Q13232 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME3Q13232 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME3Q13232 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME3Q13232 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME3Q13232 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME3Q13232 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NME3Q13232 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NME3Q13232 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME3Q13232 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME3Q13232 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME3Q13232 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME3Q13232 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME3Q13232 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME3Q13232 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME3Q13232 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME3Q13232 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME3Q13232 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME3Q13232 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME3Q13232 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NME3Q13232 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME3Q13232 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NME3Q13232 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NME3Q13232 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NME3Q13232 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NME3Q13232 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME3Q13232 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME3Q13232 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME3Q13232 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME3Q13232 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME3Q13232 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME3Q13232 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NME3Q13232 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME3Q13232 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME3Q13232 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME3Q13232 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME3Q13232 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME3Q13232 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME3Q13232 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME3Q13232 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME3Q13232 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME3Q13232 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME3Q13232 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME3Q13232 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME3Q13232 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME3Q13232 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME3Q13232 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME3Q13232 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME3Q13232 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME3Q13232 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME3Q13232 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME3Q13232 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME3Q13232 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME3Q13232 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME3Q13232 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME3Q13232 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME3Q13232 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME3Q13232 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NME3Q13232 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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