Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN12Q05209 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms