Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms