Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 TAX1BP1-207ENST00000433216 3174 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 LINC02015-202ENST00000436078 2957 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 TPO-202ENST00000345913 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 PLA2G6-202ENST00000335539 3060 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 LEPROTL1-201ENST00000321250 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 MIEF2-201ENST00000323019 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 MAMDC4-201ENST00000317446 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 GRIPAP1-207ENST00000593475 2908 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 TRIM3-203ENST00000525074 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 AL031714.1-202ENST00000568106 3107 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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