Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms