Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FOSBP53539 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOSBP53539 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOSBP53539 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOSBP53539 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOSBP53539 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOSBP53539 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOSBP53539 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOSBP53539 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOSBP53539 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOSBP53539 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOSBP53539 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOSBP53539 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOSBP53539 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FOSBP53539 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOSBP53539 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOSBP53539 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOSBP53539 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOSBP53539 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOSBP53539 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOSBP53539 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOSBP53539 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOSBP53539 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOSBP53539 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOSBP53539 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOSBP53539 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOSBP53539 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOSBP53539 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOSBP53539 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOSBP53539 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOSBP53539 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOSBP53539 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOSBP53539 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOSBP53539 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOSBP53539 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOSBP53539 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOSBP53539 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOSBP53539 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOSBP53539 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOSBP53539 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOSBP53539 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOSBP53539 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOSBP53539 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FOSBP53539 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOSBP53539 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOSBP53539 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOSBP53539 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOSBP53539 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOSBP53539 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOSBP53539 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOSBP53539 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOSBP53539 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOSBP53539 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOSBP53539 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOSBP53539 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOSBP53539 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOSBP53539 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOSBP53539 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOSBP53539 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOSBP53539 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOSBP53539 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOSBP53539 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOSBP53539 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOSBP53539 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOSBP53539 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOSBP53539 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOSBP53539 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOSBP53539 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOSBP53539 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOSBP53539 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOSBP53539 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOSBP53539 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOSBP53539 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOSBP53539 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOSBP53539 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOSBP53539 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOSBP53539 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOSBP53539 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOSBP53539 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOSBP53539 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
FOSBP53539 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOSBP53539 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOSBP53539 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOSBP53539 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOSBP53539 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
FOSBP53539 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOSBP53539 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
FOSBP53539 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOSBP53539 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOSBP53539 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
FOSBP53539 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOSBP53539 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOSBP53539 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOSBP53539 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOSBP53539 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOSBP53539 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOSBP53539 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOSBP53539 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOSBP53539 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOSBP53539 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms