Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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HOXD10P28358 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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HOXD10P28358 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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HOXD10P28358 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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HOXD10P28358 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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HOXD10P28358 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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HOXD10P28358 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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HOXD10P28358 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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