Protein–RNA interactions for Protein: P21953

BCKDHB, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial, humanhuman

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHBP21953 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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BCKDHBP21953 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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BCKDHBP21953 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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BCKDHBP21953 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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