Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms