Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB3P14651 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HOXB3P14651 AL512637.1-201ENST00000439523 1231 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HOXB3P14651 AL157385.1-201ENST00000446973 268 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HOXB3P14651 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HOXB3P14651 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB3P14651 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HOXB3P14651 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB3P14651 PQLC2L-206ENST00000468043 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB3P14651 ZSWIM7-209ENST00000486655 726 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB3P14651 CSNK1A1-207ENST00000515768 1098 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB3P14651 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB3P14651 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB3P14651 AP005597.1-201ENST00000534192 802 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HOXB3P14651 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB3P14651 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB3P14651 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB3P14651 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HOXB3P14651 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HOXB3P14651 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB3P14651 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HOXB3P14651 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB3P14651 AL359742.1-201ENST00000622497 540 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HOXB3P14651 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB3P14651 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB3P14651 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB3P14651 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB3P14651 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB3P14651 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB3P14651 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB3P14651 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB3P14651 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB3P14651 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB3P14651 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB3P14651 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB3P14651 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB3P14651 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB3P14651 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB3P14651 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB3P14651 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB3P14651 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB3P14651 IFT74-202ENST00000429045 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB3P14651 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB3P14651 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB3P14651 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB3P14651 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HOXB3P14651 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB3P14651 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB3P14651 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB3P14651 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB3P14651 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB3P14651 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB3P14651 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HOXB3P14651 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB3P14651 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB3P14651 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB3P14651 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB3P14651 SPATA45-201ENST00000332912 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB3P14651 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB3P14651 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB3P14651 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB3P14651 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB3P14651 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB3P14651 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB3P14651 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB3P14651 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB3P14651 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB3P14651 ANAPC10-202ENST00000451299 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB3P14651 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB3P14651 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HOXB3P14651 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB3P14651 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB3P14651 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB3P14651 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB3P14651 WWOX-AS1-201ENST00000567099 443 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB3P14651 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB3P14651 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB3P14651 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB3P14651 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HOXB3P14651 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HOXB3P14651 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB3P14651 AC002044.3-201ENST00000623314 541 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HOXB3P14651 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB3P14651 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB3P14651 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB3P14651 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB3P14651 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB3P14651 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB3P14651 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB3P14651 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB3P14651 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB3P14651 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB3P14651 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB3P14651 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB3P14651 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB3P14651 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB3P14651 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB3P14651 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB3P14651 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB3P14651 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.7 ms