Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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