Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms