Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms