Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC78A2IDD5 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms