Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CPNE7Q9UBL6 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CPNE7Q9UBL6 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CPNE7Q9UBL6 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CPNE7Q9UBL6 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CPNE7Q9UBL6 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CPNE7Q9UBL6 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CPNE7Q9UBL6 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CPNE7Q9UBL6 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CPNE7Q9UBL6 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CPNE7Q9UBL6 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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