Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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