Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U4

CXXC1, CXXC-type zinc finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXXC1Q9P0U4 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXXC1Q9P0U4 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXXC1Q9P0U4 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CXXC1Q9P0U4 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXXC1Q9P0U4 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CXXC1Q9P0U4 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXXC1Q9P0U4 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CXXC1Q9P0U4 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CXXC1Q9P0U4 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CXXC1Q9P0U4 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CXXC1Q9P0U4 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CXXC1Q9P0U4 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CXXC1Q9P0U4 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CXXC1Q9P0U4 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CXXC1Q9P0U4 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CXXC1Q9P0U4 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CXXC1Q9P0U4 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CXXC1Q9P0U4 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CXXC1Q9P0U4 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CXXC1Q9P0U4 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms